Řídicí orgán Operačního programu Podnikání a inovace zajišťuje, že v průběhu všech fází
přípravy a realizace programu je posuzována jeho slučitelnost s politikami Společenství.
Detailní informace o podmínkách slučitelnosti poskytování podpory s předpisy Společenství v
rámci OPPI jsou obsaženy ve výzvách jednotlivých programů podpory OPPI.
Všechny instituce zainteresované do tvorby OPPI jsou na základě Páteřního manuálu OPPI
zavázány dbát zásady slučitelnosti připravovaných oblastí podpor s politikami Společenství.
Zprostředkující subjekt, který se podílí na výběru projektů, bude povinen se podílet na
základě Páteřního manuálu OPPI na kontrole slučitelnosti postupů aplikovaných při
implementaci s pravidly platnými v EU.